陈独秀说苏曼殊：“至于人情世故上面，曼殊实在也是十分透彻，不过他不肯随时俯仰，只装作癫癫疯疯的样儿，以佯狂免祸罢了。章太炎做的文章上，说他不解人事，几乎形容他是个傻子，其实他住在日本的时候，太炎和刘申叔冲突的原因，他完全是明白的。好在他们都当他是傻子，什么事不去回避他，而他也一声不响，只偷偷跑来告诉我。”晚年，陈在狱中说：“苏曼殊是个风流和尚，人极聪颖，诗、文、书、画都造上乘，是大有情人，是大无情人，有情说他也谈恋爱，无情说他当和尚。”
孙中山将苏曼殊与当时的名僧太虚和尚进行比较道：“太虚近伪，曼殊率真。内典工夫，固然曼殊为优；即出世与入世之法，太虚亦逊曼殊多多也。”
周作人对苏曼殊作了多方位的评价：
评价曼殊其人云：“曼殊是一个很有天分的人，看他的绝句与小品文可以知道，又生就一副浪漫的性情，颇足以代表革命前后的文艺界的风气。”
批评他的思想云：“但是他的思想，我要说一句不敬的话，实在不大高明，总之逃不出旧道德的樊篱——这在诗人或者是南北二宗诸大师，而自合榘度，其所作，疑皆寓身世难言之恫，以不着点尘之笔，写不可一世之情，扣于窈冥，诉于真宰，一丘一壑，妙极其微，或钓艇荒滩，灵旗破庙，或金轮飞锡，千刃振衣，或敷行衰柳，摇落山川，或红叶小桥，有人吹笛，莫不神出古异，灵光接天，表圣有言，性情所至，妙不自寻，遇之自天，冷然希音，上人画境，当于此中喻之，殊不能以一家一派，量度其价值也。”
友人高燮曾诗赠苏曼殊曰：“住心常觉众生苦，冷眼犹嫌热泪多。”
顾彬说：“苏曼殊是文言文最后一位大师，同时也是第一位对于病态没有采取回避态度的作家，在作品中对病态做了不加粉饰的描写。”
在陈平原看来，苏曼殊出于脱苦脱俗的需要，强迫自己信仰佛教，潜意识里却始终浮躁不安，他的作品正是“在东西文化、俗圣生活的矛盾中苦苦挣扎的心灵的自白”。
茗山大师说，自己在“禅堂参悟，而曼殊于妓院得道”。
印顺大师说：“中国有两大诗僧，前有佛印，今有曼殊。”
戴季陶回忆道：“我还记得死朋友中，有一个苏玄瑛，这个人是我所不愿学，同时也是我所不能学的一个人。他的性情，也很有超绝一切的去处，但是他到底是一个个人主义的结晶。就超生活的一面看，他也是一个人类中的优秀，却是在生活里面看，他倒是一个累世的人。这样的人，高而不崇，洁而不纯，于个人可成为良友，与社会绝不能不说是赘疣。”